Отделение оснащено  современным видеоэндоскопическим комплексом с установками для ультразвуковой и флуоресцентной эндоскопии, которые позволяют определить распространение опухоли в ткани. В отделении проводятся диагностические исследования: фибробронхоскопия, фиброгастродуоденоскопия, колоноскопия и полипэктомия при колоноскопии.

Заведует отделением Дмитрий Евгеньевич Новиков.